В середине 1960-х годов стало ясно, что машины ЗиУ-5 уже не справляются с пассажиропотоками. Проводились эксперименты по «врезанию» средней двери, (так родился ЗиУ-5Е) однако это не помогло решить проблему огромной нагрузки на передний мост. Потому в 1965 году на заводе имени Урицкого начата разработка нового троллейбуса – ЗиУ-9.

ЗиУ-9 №5000

Спор вызывают две фотографии прототипа ЗиУ-9, отличающегося выступающими над крышей окошками маршрутоуказателей (как в автобусах MAN SL200). Информации о его работе на маршрутах нет, однако известно две фотографии. На этих фото троллейбус без бортового номера и маршрутоуказателей, потому установить его судьбу сложно. По одной из версий, это прототип ~1966-1967г.в., по другой – это и есть оригинальный вид ЗиУ-9 образца 1966 года, который позже был переоборудован (например, лишился боковых маршрутоуказателей), перекрашен аналогично ЗиУ-9А и в 1968 году поступил в Москву, где и получил номер 5000.

ЗиУ-9А №5001

Троллейбусы ЗиУ-9 и ЗиУ-9А проходили испытания в Москве в 1968-1969 годах. По результатам испытаний был выбран ЗиУ-9 со стандартной шириной кузова, и в 1970 году было выпущено два троллейбуса ЗиУ-9, имевших кузов, который лёг в основу всех следующих моделей и модификаций ЗиУ-9. По результатам испытаний в машину были внесены как внешние, так и внутренние изменения. По неподтверждённой информации, существовало ещё два опытных образца 1971г.в., внешне практически не отличавшихся от серийного ЗиУ-682Б.